Biologie structurale, génomique Biochimie structurale (BS)

Assemblages Macro-Moléculaires

  1. Introduction
  2. Taille des Protein Protéines: Oligomerisation; Symmetrie; Propriétés de Surface
  3. Methodes d'Analyse Structurale; Comparaison Cristallographie+RMN+Microscope Electronique; Notion de Tomographie; Multiresolution
  4. Protéines Desordonnées (SL)
  5. Introduction Assemblages Viraux: Relations Structure-Fonction
  6. Cryo-Microscopie Electronique (ED+AG)
  7. Examples d'Assemblages: Clatherine; Dynamine; Cytoskelette; Moteurs; Etc
  8. Présentations d'Articles par les Etudiants

Modélisation moléculaire - JP Duneau (6H cours-TD + 6H TP)

-Mécanique moléculaire et champs de forces

-Modélisation basée sur les connaissances

-Modélisations ab initio

Diffusion moléculaire et modélisation - A. Sergé (6H cours-TD)

Docking moléculaire et drug design - S. Betzi (6H cours-TD + 6H TP)

Dynamique des réseaux d'intéractions moléculaires
    - Approches biochimiques
    - Co-évolutions et approches théoriques

Dynamique enzymatique
    - Réaction à 2 substrats (enz. Formelle)
    - Etat prestationnaire (Stop flow et temp. Jump, relaxation cinétique)
    - Effets isotopiques (y compris mécanismes)
    - Régulation

Dynamique et thermodynamique
    - FRAP, FCS
    - EPR et marquage de spin
    - Protéines Intrinséquement Désordonnées
 
Simulations
    - Relation structure-dynamique fonction
    - Champs de forces
    - Principes et mise en œuvre
    - TP  de simulation de dynamique moléculaire