Assemblages Macro-Moléculaires
Ce cours a comme objectif la présentation des aspects structuraux spécifiques aux assemblages macromoléculaires et aux demarches expérimentales pour les caracteriser. Le cours décrit des aspects pertinants de la structure des assemblages tels que la morphoologie, la stabilité relative des assemblages, les caracteristiques des surfaces d'interaction entre monomères, les relations de symmétrie, etc. Au delà d'un rappel sur les démarches de biologie structurale sous-jacentes, le cours fait la présentation de différents assemblages de référence, qui permettent d'illustrer la diversité des interactions et l'illustration de caractéristiques communement trouvées dans ces structures. Des interventions par des chercheurs et par les étudiants suivant le cours permettent d'aborder différentes thématiques structurales.
- Introduction
- Taille des Protein Protéines: Oligomerisation; Symétrie; Propriétés de Surface
- Méthodes d'Analyse Structurale; Comparaison Cristallographie+RMN+Microscope Electronique; Notion de Tomographie; Multi-résolution
- Protéines Désordonnées (SL)
- Examples d'Assemblages: Assemblages Viraux et leurs Relations Structure-Fonction
- Examples d'Assemblages: Clatherine; Dynamine; Cytoskelette; Moteurs Moléculaires; Etc
- Présentations d'Articles par les Etudiants
- TP: Introduction pratique à la Cryo-microscopie (Préparation de Grilles; 1ère analyse d'Images)
- معلم: Rhian JONES
- معلم: Pedro MALDONADO COUTINHO
- معلم: Denis PTCHELKINE
Modélisation moléculaire - JP Duneau (6H cours-TD + 6H TP)
-Mécanique moléculaire et champs de forces
-Modélisation basée sur les connaissances
-Modélisations ab initio
Diffusion moléculaire et modélisation - A. Sergé (6H cours-TD)
Docking moléculaire et drug design - S. Betzi (6H cours-TD + 6H TP)
- معلم: Stephane BETZI
- معلم: Jean pierre DUNEAU
- معلم: Arnauld SERGE
- معلم: Carole BAFFERT
- معلم: Myriam BRUGNA
- معلم: Sebastien DEMENTIN
- معلم: Jean pierre DUNEAU
- معلم: Emilien ETIENNE
- معلم: Stephane GRIMALDI
- معلم: Bruno GUIGLIARELLI
- معلم: Marlene MARTINHO
- معلم: Elisabetta MILEO
- معلم: Eric PILET
- معلم: James STURGIS
Dynamique des réseaux d'intéractions moléculaires
- Approches biochimiques
- Co-évolutions et approches théoriques
Dynamique enzymatique
- Réaction à 2 substrats (enz. Formelle)
- Etat prestationnaire (Stop flow et temp. Jump, relaxation cinétique)
- Effets isotopiques (y compris mécanismes)
- Régulation
Dynamique et thermodynamique
- FRAP, FCS
- EPR et marquage de spin
- Protéines Intrinséquement Désordonnées
Simulations
- Relation structure-dynamique fonction
- Champs de forces
- Principes et mise en œuvre
- TP de simulation de dynamique moléculaire
- معلم: Gilles BREUZARD
- معلم: Myriam BRUGNA
- معلم: Jean pierre DUNEAU
- معلم: Corinne KREUZER
- معلم: Marlene MARTINHO
- معلم: Eric PILET
- معلم: James STURGIS
- معلم: Frederic BIASO
- معلم: Benedicte BURLAT
- معلم: Elsa GARCIN
- معلم: Marianne ILBERT
- معلم: Sonia LONGHI
- معلم: James STURGIS