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UE "Introduction à la bioinformatique", L2 Sciences du vivant.

Avec le tournant du 20ème au 21ème siècle, la biologie a connu un changement d’échelle d’observation. Elle s’est intéressée aux mêmes objets que précédemment – molécules, cellules, organismes, populations, écosystèmes – mais en les appréhendant de façon holistique, grâce au développement de technologies visant à caractériser l’ensemble des composantes d’un système (génome, suivi du transcriptome, protéome, interactome, phénome). La bioinformatique est devenue l’indispensable compagne de cette évolution, en développant de nouveaux outils pour analyser, représenter et interpréter les données massives produites par ces technologies dites “omiques”. Dans quasiment tous ses domaines d’application, la biologie s’est transformée en une science des données. Les cours magistraux dresseront un panorama des approches bioinformatiques actuelles et les illustrera par des applications à différents domaines de la biologie, en mettant l’accent sur la santé humaine et la biodiversité. Les travaux pratiques amèneront les étudiants à découvrir des outils bioinformatiques faciles d’accès (sans compétence prérequise en informatique) pour interroger les données afin de répondre à des questions biologiques ciblées. Le cours s’adresse à des étudiants de 2ème année de licence en biologie. Il présuppose une connaissance des notions de biologie enseignées en première année de licence ainsi qu’une familiarité avec les notions basiques de mathématiques enseignées au lycée, mais ne nécessite pas de connaissance préalable en bioinformatique ou d’informatique.