Les premiers cours seront consacrés aux différents formats de publication : article original, revue, commentaire, etc… Les modalités de diffusion seront également abordées ainsi que les notions de propriété intellectuelle et d'open access. Une attention particulière sera apportée aux plateformes d'aide à la recherche bibliographique. Enfin, les étudiants seront sensibilisés à l'utilisation de la bibliométrie. L'organisation d'une publication scientifique sera abordée et chaque section fera l'objet d'une description détaillée en se basant sur les instructions aux auteurs de diverses revues scientifiques (résumé, introduction, matériel et méthodes, etc…).

Dans un deuxième temps, plusieurs ressources bibliographiques portant sur une thématique centrale à la microbiologie (et si possible d'actualité) seront mises à la disposition des étudiants. A partir de ces documents, les étudiants devront rédiger une revue ou un commentaire en français par groupes ou trois ou quatre ainsi qu'un résumé en français et en anglais. Ils devront pour cela appliquer les principes de rédaction scientifique abordés lors des cours introductifs. Ils auront à insérer dans leur article des encadrés qui vulgarisent des méthodes/concepts/approches utilisés par les auteurs sans être le thème central de l'étude. Le logiciel de détection du plagiat URKUND sera utilisé par les enseignants pour s'assurer que les rapports sont des textes originaux.